我国地市级农业科研院所近600家，是我国农业科研体系的重要组成部分，育种区位优势突出。近年来，我国地市级农业科研院所健康发展，综合水平有了较大提高，但还存在以下主要问题：一是定位不清、管理薄弱，体制机制的不健全制约了种业的科技创新。二是中央、省、市三级农业科研院所没有形成合力，同质竞争激烈。三是经费不足、人才短缺，科研人员积极性不高。为此，建议：

　　一、明确定位、强化管理，完善体制机制。尽快将我国地市级农业科研院所改革提上议事日程，根据地区和不同产业发展需求，进行科学规划和合理布局。对周期长、比较效益差的生物育种，建立长期支持机制；对取得重大社会效益的育种创新品种，健全创新激励机制，给予后补助。

　　二、上下联动、强化指导，形成创新合力。深化中央、省、市三级农业科研院所指导合作，在申报种业科研项目时，发挥国家队领头作用，地方农业科研院所有序参与、形成合力；推动中央和省建立一批不同类型层级的区试站，改善试验条件，保证品种比较试验质量；鼓励地市级农业科研院所与种业企业合作，集中优势力量选育一批突破性强的新品种，支持地方种业发展。

　　三、加大投入、精准支持，营造良好生态。一是着眼国家农业产业规划，从国家层面继续稳定支持一批具有比较优势的地市级育种单位；二是着眼种质资源保护、挖掘和利用，从需求层面选择支持一批有实力的科研单位；三是着眼以企业为主体、市场为导向、产学研协同、育繁推一体的育种协作攻关机制，从科研层面支持现代化商业育种体系建设，重视育种人才队伍建设，充分调动科研人员积极性，推进“放管服”改革，营造良好人才环境和科研生态。